التعفن في الفاكهه عموما ومن ضمنها ثمرة التفاح هو تطور عمل البكتيريا علي سطح الثمرة مما يؤدي إلي تعفنها. ويتعرض التفاح لأحد انواع التعفن والذي يسمي بالتعفن المر وسببه أحد انواع الفطر ومراحل تطور العفن المر علي التفاح هي: يصنع الفطر بقعة بُنية اللون في الفاكهة ثم تنمو البقعة اتساعا وعمقًا، وقد تصبح الفاكهة في آخر المطاف ذات مذاقاً مراً.