تختص هيئة الرقابة و التحقيق في اجراء الكشف عن المخالفات المالية والإدارية وفحص الشكاوى التي تحال لها ومتابعة الدعاوي المحالة لها. أما هيئة التحقيق و الإدعاء العام فتقوم بالتحقيق في الجرائم وتقوم بالتصرف في التحقيق برفع الدعاوى او حفظها للجهات القضائية.